El pueblo nace a partir del afincamiento de pequeños productores de campo alrededor de la Estación del ferrocarril a partir de la instalación del ramal de la línea General Urquiza. El nombre de Gilbert se impuso por decreto el 21 de enero de 1890 en homenaje a Torcuato Gilbert, ministro del gobernador Clemente Basavilbaso, en cuyo mandato (1887-1891) se habilitó la estación en el kilómetro 78.950 del ramal Gualeguaychú-Basavilbaso.
